Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade

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TRABALHO Ações
O gênero Stereocaulon (Schreb.) Hoffm. (Ascomycota liquenizados, Stereocaulaceae) em altas montanhas e altas latitudes na América do Sul e na Antártica
Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
Tipo Tese
Data 11/12/2023
Área BIOTECNOLOGIA
Orientador(es)
  • Aline Pedroso Lorenz
Orientando(s)
  • Jean Marc Edson Torres Pineda
Banca
  • Aline Pedroso Lorenz
  • Bibiana Moncada
  • Emerson Luiz Gumboski
  • Harrie Sipman
  • Manuela Dal Forno
  • Marcos Junji Kitaura
  • Wellington Santos Fava
Resumo Stereocaulon (Schreb) Hoffm. é um gênero de liquens tripartido: os talos resultam da associação simbiótica entre um fungo Ascomycota, uma alga verde e uma cianobactéria. Há cerca de 150 espécies aceitas mundialmente, e sua distribuição é cosmopolita, embora a maioria das espécies tenha certa preferência por regiões de altas altitudes e latitudes. Os talos de Stereocaulon são facilmente reconhecíveis em campo, mas a identificação das espécies não é uma tarefa fácil. A alta variabilidade fenotípica intraespecífica é pouco discutida nos trabalhos e pode levar a identificações errôneas. Na Antártica e na América do Sul, os trabalhos são escassos; a maioria dos estudos que avaliam a taxonomia e sistemática do gênero é baseada principalmente em espécimes da Europa, América do Norte e Ásia. Com o objetivo de contribuir ao entendimento da taxonomia e sistemática de Stereocaulon a partir de espécimes provenientes do hemisfério sul, neste estudo foram realizadas análises morfológicas, químicas e moleculares de espécies encontradas na Terra do Fogo e Patagônia (Argentina e Chile), na Antártica, nos campos de altitude do Brasil e nos Páramos andinos da Colômbia. No total foram examinados 920 espécimes de Stereocaulon. Para cada espécie apresentamos informações sobre a morfologia, a anatomia e a composição química. Também geramos 332 novas sequências do espaçador interno transcrito do DNA nuclear (nuITS) e 97 novas sequências do gene codificador da proteína beta tubulina (β-tubulin) para os micobiontes, e cinco novas sequências do gene codificador da proteína actina I (ACT1) e dez da região 16S do DNA ribossômico (16S rDNA) para o clorobionte e o cianobionte de S. alpinum, respectivamente, totalizando 444 novas sequências geradas. Foram identificadas 22 espécies de Stereocaulon, sendo sete para as altas latitudes do sul da América do Sul na Argentina e Chile, três para a Antártica, quatro para os campos de altitude no Brasil e 17 para os páramos andinos da Colômbia. Stereocaulon alpinum foi caracterizada, descrita e confirmada como espécie bipolar. Para os campos de altitude no Brasil, S. vesuvianum representa um novo registro para território brasileiro. Neste estudo, percebemos que em alguns casos, as descrições encontradas na literatura não abrangem nem refletem a variabilidade morfológica encontrada nas espécies. Descrições sobre a morfologia, anatomia e química são de grande importância para a circunscrição de cada espécie, que se vê refletida e comprovada nas análises moleculares. As ferramentas moleculares são imprescindíveis para realizar análises integrativas que permitam um melhor entendimento da sistemática do gênero.
Palavras-chave: filogenia, fungos, simbiose, taxonomia.
TAXONOMIA INTEGRATIVA EM LIQUENS PARMELIOIDES (PARMELIACEAE) DO BRASIL
Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
Tipo Tese
Data 08/12/2023
Área BIOTECNOLOGIA
Orientador(es)
  • Aline Pedroso Lorenz
Orientando(s)
  • Andressa Silva Rodrigues
Banca
  • Adriano Afonso Spielmann
  • Aline Pedroso Lorenz
  • Flavio Macedo Alves
  • Gecele Matos Paggi
  • Natália Mossmann Koch
  • PRISCILA CANESQUI DA COSTA
  • Wellington Santos Fava
Resumo Fungos liquenizados compreendem diferentes organismos funcionando como um ecossistema autossustentável, uma complexa forma de vida mutualística benéfica entre fungos, algas verdes e/ou cianobactérias, além de outros microrganismos. Possuem mais de 19 mil espécies conhecidas, sendo Parmeliaceae a mais diversa. Ela é dividida em duas subfamílias: Protoparmelioideae e Parmelioideae. Esta última, ainda é subdividida informalmente em sete clados, sendo que o clado Parmelioide, com representantes predominantemente foliosos, agrupa cerca de 67% da diversidade da família. Por muitos anos os liquens têm sido identificados baseado apenas em características morfológicas, mas com adventos moleculares, novas ferramentas para identificação desses organismos têm ganhado espaço, como o uso do DNA barcoding, e mais atualmente a associação desse com a taxonomia integrativa. Esta abordagem tem como objetivo utilizar diferentes fontes de dados para a identificação e/ou delimitação específica, e tem mostrado alta eficiência nos resultados obtidos. Assim, nosso estudo tem como objetivo utilizar a abordagem integrativa e o DNA barcoding (baseado no marcador nuITS) nas espécies do clado Parmelioide de Parmeliaceae de algumas localidades do Brasil. No primeiro capítulo, realizamos a combinação das espécies Canoparmelia amazonica e Myelochroa lindmanii no gênero Parmelinella. Confirmamos o posicionamento dessas espécies através da filogenia molecular (nuITS), propondo assim, a combinação de ambas sob o gênero Parmelinella. Além disso, também fornecemos descrições morfológicas e químicas e imagens, subsidiando a nova classificação. No segundo artigo propomos Hypotrachyna neohorrescens como nova espécie (subgênero Parmelinopsis). Hypotrachyna neohorrescens é proximamente relacionada com H. mcmulliniana, porém com baixa, utilizando apenas o marcador nuITS. A distinção filogenética de ambas só foi possível com marcadores concatenados (nuITS+mtSSU). Morfologicamente as espécies também apresentam diferenças sutis. Além disso, não encontramos diferenças morfológicas e químicas entre Hypotrachyna neohorrescens e H. horrescens, mas geneticamente, possuem grande divergência, sendo, portanto, consideradas espécies crípticas. No terceiro e último capítulo realizamos a identificação integrativa de 90 espécimes de liquens coletados no extremo sul do Brasil. Inicialmente fizemos a identificação morfológica, encontrando 39 morfoespécies. Com a identificação molecular baseada em DNA barcoding (marcador nuITS), utilizando o BLASTn para verificar as espécies mais próximas das sequências, e, posteriormente, reconstruímos as filogenias por gênero e usando como sequências de referências aquelas disponíveis no banco de dados público – GenBank. Baseado nos resultados das três abordagens (DNA barcoding, análises do BLASTn e filogenia), entre as 39 morfoespécies, 22 continham sequências homônimas, ou seja, sequências com mesmo nome no banco de dados GenBank. Todavia os resultados das filogenias mostraram que 20 morfoespécies agruparam com sequências de mesma identidade, mas 10 delas apresentaram também diferentes espécies nos clados. Entre as 17 morfoespécies sem sequência homônimas, somente seis mostraram ser geneticamente distintas das demais sequências do GenBank, enquanto as demais apresentaram alguma incongruência entre as abordagens. Encontramos pelo menos 22 casos de possíveis complexos de espécies em nossos dados, os quais não foram solucionados utilizando apenas o marcador nuITS. Nossos resultados corroboram com estudos recentes, os quais destacam a falta de resolução do marcador nuITS em complexos de espécies. Tornando assim a tarefa de usar apenas DNA barcoding como ferramenta de identificação específica ainda mais desafiadora.
Potencial anti-inflamatório, antimicrobiano e antibiofilme de Miconia albicans
Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
Tipo Tese
Data 24/03/2023
Área BIOTECNOLOGIA
Orientador(es)
    Orientando(s)
      Banca
      • Ana Camila Micheletti
      • Denise Brentan da Silva
      • Nadla Soares Cassemiro
      • Saulo Euclides Silva Filho
      • Thalita Bachelli Riul
      Resumo
      POTENCIAL ANTI-INFLAMATÓRIO, ANTIMICROBIANO E ANTIBIOFILME DAS FOLHAS DE MICONIA ALBICANS (MELASTOMATACEAE)
      Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
      Tipo Tese
      Data 24/03/2023
      Área BIOTECNOLOGIA
      Orientador(es)
      • Denise Brentan da Silva
      Orientando(s)
      • Djaceli Sampaio de Oliveira Dembogurski
      Banca
      • Ana Camila Micheletti
      • Denise Brentan da Silva
      • Lilliam May Grespan Estodutto da Silva
      • Nadla Soares Cassemiro
      • Saulo Euclides Silva Filho
      • Thalita Bachelli Riul
      Resumo Miconia albicans (Melastomataceae) é conhecida popularmente pelo nome canela de velho e suas folhas são utilizadas em forma de chá para tratar principalmente inflamações e dores articulares. No entanto, escassas evidências científicas avaliam o potencial anti-inflamatório in vivo correlacionado ao perfil químico e a variação sazonal de seus constituintes. Com isso, foi obtido um extrato aquoso das folhas de M. albicans (MAAE), similar ao utilizado pela população, e o mesmo foi submetido a ensaios de inflamação, analgesia e toxicidade. MAAE exibiu na dose de 256 mg/kg, uma inibição do efeito edematogênico nos animais tratados, assim como uma redução da migração leucocitária, diante a resposta inflamatória aguda. As contorções abdominais induzidas por ácido acético foram reduzidas no tratamento com MAAE no teste de nocicepção, bem como o tempo de lambida de pata, mostrando um potencial nociceptivo. MAAE não provocou efeitos toxicológicos nos ensaios de toxicidade aguda e de doses repetidas. Os animais não apresentaram alterações quando analisados os parâmetros bioquímicos, histológicos e hematológicos. A atividade antimicrobiana e antibiofilme de MAAE e 4 frações foram avaliadas frente as bactérias Staphylococcus aureus e Pseudomonas aeruginosa, onde todas as amostras submetidas não apresentaram atividade eficaz contra as cepas patogênicas. A análise fitoquímica feita pela técnica de CLAE-DAD-EM, possibilitou anotar vinte e quatro compostos a partir do MAAE, como megastigmanos, flavonoides, elagitaninos e triterpenos, destacando que essas classes de metabólitos são reconhecidas por seu potencial anti-inflamatório. Na investigação sazonal, 4 indivíduos da mesma espécie foram monitorados durante 10 meses, dessa forma, observou-se que as estações seca e chuvosa interferem na produção de metabólitos secundários da planta. Sendo observado que as classes de flavonoides e megastigmanos ocorrem com maior intensidade no período de seca, enquanto os taninos ocorrem mais intensamente em estação chuvosa. Neste trabalho, a classe dos megastigmanos foram identificados pela primeira vez no gênero Miconia, assim como não haviam informações na literatura inferindo a variação sazonal relacionada a esses compostos.
      Senecavirus A - Uma abordagem biotecnológica para a vigilância em doenças vesiculares
      Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
      Tipo Dissertação
      Data 09/12/2022
      Área BIOTECNOLOGIA
      Orientador(es)
        Orientando(s)
          Banca
          • Edgar Julian Paredes Gamero
          Resumo
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            Senecavirus A - Uma abordagem biotecnológica para a vigilância em doenças vesiculares
            Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
            Tipo Dissertação
            Data 09/12/2022
            Área BIOTECNOLOGIA
            Orientador(es)
            • Edgar Julian Paredes Gamero
            Orientando(s)
            • Juliana da Silva Gomes Rieger
            Banca
            • Cleber Eduardo Galvão Carvalho
            • Cynthia Mantovani
            • Edgar Julian Paredes Gamero
            • Flábio Ribeiro de Araújo
            • Ingrid Batista Pinto
            • Lenita Ramires dos Santos
            • Sebastiao Martins de Souza Neto
            Resumo RIEGER, Juliana. S.G., Universidade Federal do Mato Grosso do Sul, Dezembro, 2022. Senecavirus A – Uma abordagem biotecnológica para a vigilância em doenças vesiculares. Orientador: Dr. Edgar Julian Paredes Gamero. Co-Orientadora: Dra. Lenita Ramires dos Santos. Senecavirus A (SVA) é um vírus não envelopado, RNA de fita simples de senso positivo do gênero Senecavirus, família Picornaviridadae. Este vírus causa doença vesicular em suínos, clinicamente indistinguível de outras doenças, tal como febre aftosa, doença vesicular de suínos, estomatite vesicular e exantema vesicular de suínos. Os principais sinais clínicos são lesões vesiculares em suínos e morte em leitões. No Brasil, surtos foram reportados inicialmente no final de 2014, e desde então, tem causado prejuízos na suinocultura, principalmente devido a doença possuir similaridade com febre aftosa, uma doença devastadora na suinocultura e de grande importância econômica. Diante desse cenário, se faz necessário o aprimoramento de testes diagnósticos. Neste estudo, a proteína recombinante viral 2 (VP2) foi produzida para o desenvolvimento de um ensaio ELISA indireto para identificar a presença e níveis de anticorpos contra SVA em propriedades brasileiras de produção de suínos. Valores de sensibilidade e especificidade do ELISA baseado em VP2 foram determinados utilizando a análise da curva ROC com 43 amostras de soro positivas e 219 amostras negativas. Adicionalmente, amostras de soro de suínos imunizados com oito distintas cepas brasileiras de SVA inativadas (MF615501, MF615502, MF615503, MF615505, MF615506, MF615507, MF615509 e MZ456812) foram testadas com o ELISA. A reação cruzada com estomatite vesicular foi testada utilizando soro de 17 suínos naturalmente infectados e positivos para esta doença. Como resultado, o ELISA baseado em VP2 apresentou 100% de especificidade e 74,4% de sensibilidade. Na fase aguda da doença, a sensibilidade do teste foi de 100% e 9 meses após o início dos sinais clínicos a sensibilidade do teste diminuiu para 73.35%. O ELISA desenvolvido neste estudo foi capaz de detectar anticorpos específicos em soro de suínos que receberam três das oito cepas brasileiras inativadas. Adicionalmente, possibilitou a detecção de anticorpos de SVA de animais na fase aguda e crônica e não apresentou reação cruzada com estomatite vesicular. Este ensaio é uma ferramenta útil no monitoramento e diagnóstico da doença.


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            Avaliação do efeito cardioprotetor do extrato aquoso das folhas de Rudgea virbunoides benth. em ratos com hipertensão renovascular
            Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
            Tipo Tese
            Data 26/11/2021
            Área BIOTECNOLOGIA
            Orientador(es)
            • Denise Brentan da Silva
            Orientando(s)
            • Fernanda Viana Paulin
            Banca
            • Bruna Paola Murino Rafacho
            • Denise Brentan da Silva
            • Eduardo Benedetti Parisotto
            • Lais Alves de Souza Bonilha
            • Monica Cristina Toffoli Kadri
            • Priscila de Souza
            • Saulo Euclides Silva Filho
            Resumo A hipertensão arterial sistêmica (HAS) consiste numa condição clínica multifatorial
            caracterizada por níveis elevados e sustentados de pressão arterial. É também o principal
            fator de risco para as alterações funcionais e/ou estruturais dos órgãos alvo e as alterações
            metabólicas, com consequente aumento do risco de eventos cardiovasculares fatais e não
            fatais. O tratamento para o controle da HAS inclui ações de mudança de estilo de vida e
            utilização de medicamentos, como diuréticos, simpaticolíticos, vasodilatadores,
            bloqueadores de canais de cálcio, inibidores da enzima conversora de angiotensina e
            bloqueadores do receptor de angiotensina II. Neste contexto, insere-se também o
            tratamento com administração de fitoterápicos ou a utilização de plantas medicinais em
            formas de chás, infusão e macerações. Sabe-se, que algumas substâncias químicas
            presentes em determinadas plantas são associadas com a prevenção ou tratamento das
            doenças cardiovasculares (DCV), por exemplo Rudgea viburnoides (Cham.) Benth. é
            pertencente a família Rubiaceae, popularmente conhecida como congonha, congonha-de-
            bugre ou bugre e utilizada na medicina tradicional sob a forma de chá, devido suas
            propriedades antirreumáticas, diuréticas, hipotensoras e depurativas do sangue . Ela é uma
            espécie comum do Cerrado e potencial diurético e antioxidante já descritos. O objetivo
            desse estudo foi avaliar os efeitos da administração prolongada do extrato aquoso obtido
            de folhas de Rudgea Viburnoides (Cham.) Benth. (EARV) no comprometimento do
            estresse oxidativo, disfunção renal e dano cardiovascular em ratos hipertensos 2K1C. Além
            disso, também determinar a composição química de EARV através de cromatografia
            líquida de alta eficiência acoplada ao detector de arranjo de diodos e espectrometria de
            massas (CLAE-DAD-EM). Para tal, o EARV foi obtido através de extração acelerada com
            solvente e este extrato foi analisado por CLAE-DAD-EM. Além disso, também foi
            realizado teste de toxicidade aguda em ratos Wistar fêmeas. Foi induzida cirurgicamente,
            em ratos Wistar machos, a hipertensão renovascular (dois rins, modelo de um clipe). O
            EARV foi administrado por via oral nas doses de 30, 100 e 300 mg / kg, diariamente
            durante 28 dias, por 5 semanas após a cirurgia. Nos dias 1, 7, 14, 21 e 28 a função renal foi
            avaliada por análise de volume e parâmetros urinários, bem como eletrólitos urinários, pH
            e densidade. No 29° dia, por eletrocardiografia, foram registradas a pressão arterial e a
            frequência cardíaca. Também foram obtidas amostras de sangue para avaliação da
            atividade da enzima conversora de angiotensina plasmática e mensuração sérica de Na+,
            K+, uréia e creatinina. Posteriormente, foram isolados respectivamente, os leitos vasculares
            mesentérico e tecido cardíaco para morfometria cardíaca e avaliação da reatividade
            vascular. Ao final, foram coletadas para avaliação do estresse oxidativo tecidual, amostras
            da aorta, coração e rim. Através das análises por CLAE-DAD-EM, os compostos
            identificados em no EARV foram ácido quínico, bem como ácidos clorogênicos, um
            iridóide glicosilado, flavonóis O-glicosilados, saponinas e um triterpenos. Na avaliação da
            toxicidade aguda, não foi observado nenhum sinal após o tratamento com dose única de
            EARV. O tratamento prolongado com EARV em ratos hipertensos foi capaz de preservar
            a excreção urinária e os níveis de eletrólitos (Na+, K+, Ca2+ e Cl-) de maneira semelhante
            ao grupo operado por Sham (controle negativo). Adicionalmente, o tratamento prolongado
            com EARV foi capaz de reverter as alterações eletrocardiográficas, o aumento da pressão
            arterial e da frequência cardíaca em ratos hipertensos 2K1C, bem como reverter a
            hipertrofia ventricular esquerda e as alterações na reatividade vascular induzidas pela
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            hipertensão. Assim, esse efeito foi associado a uma modulação positiva do estresse
            oxidativo tecidual, ativação da via NO/cGMP e inibição da enzima de conversão da
            angiotensina, o que indica um potencial mecanismo para os efeitos renais e
            cardiovasculares de AERV. Assim, pode-se dizer que o tratamento de 28 dias com AERV
            reduziu a progressão da doença cardiorrenal em ratos hipertensos 2K1C.
            Monitoramento da cepa vacinal Brucella abortus B19 em bezerras: positividade no período pré vacinação
            Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
            Tipo Tese
            Data 16/10/2020
            Área BIOTECNOLOGIA
            Orientador(es)
            • Cleber Oliveira Soares
            Orientando(s)
            • Cynthia Mantovani
            Banca
            • Carina Elisei de Oliveira
            • Cleber Eduardo Galvão Carvalho
            • Cristiano Marcelo Espinola Carvalho
            • Grácia Maria Soares Rosinha
            • Sebastiao Martins de Souza Neto
            • Vanessa Felipe de Souza
            Resumo A brucelose bovina é uma doença zoonótica que tem grande impacto econômico no mercado de produtos de carne e leite. Como o Brasil possui um dos maiores rebanhos bovinos do mundo, essa doença é um importante problema de saúde pública. Em 2001, foi lançado o Programa Nacional de Controle e Erradicação da Brucelose e Tuberculose Animal (PNCEBT), o qual foi revisado em 2017. Este programa incluiu a vacinação de bezerras com idade entre 3-8 meses com a vacina B19, uma cepa lisa atenuada, e o monitoramento com base em testes sorológicos. Algumas pesquisas relatam a persistência e excreção da cepa B19. Nesse contexto, objetivou com este estudo monitorar a persistência da cepa vacinal em amostras de sangue de 10 bezerras vacinadas com idade entre 6-8 meses e investigar a soroconversão com o intuito de verificar a imunogenicidade da vacina. A Reação em Cadeira de Polimerase (PCR) foi realizada em diferentes períodos de tempo: “dia zero” (antes da vacinação), 1 a 15 dias após a vacinação e mensalmente até completar 12 meses, totalizando 28 coletas. A positividade da cepa vacinal ocorreu ao longo do estudo, mesmo no dia zero, antes das bezerras serem vacinadas. O sequenciamento confirmou a presença da cepa vacinal B19. Com base no teste sorológico Antígeno Acidificado Tamponado (AAT), não houve aglutinação nas amostras do “dia zero”, portanto a resposta imune foi negativa. Esta resposta começou a partir do quarto dia após a vacinação com duas amostras positivas e, todas as amostras ficaram positivas a partir do sétimo dia. É possível concluir que a técnica de PCR foi capaz de detectar a cepa B19 presente em uma quantidade antes da vacinação, a qual não é suficiente para induzir uma resposta imune, mas a cepa está presente. Uma hipótese que poderia explicar essa positividade antes da vacinação, é que as mães já vacinadas poderiam ter transmitido a cepa vacinal para as bezerras, pois possivelmente apresentavam excreção da cepa B19 no leite e/ou urina. Este é o primeiro relato sobre a presença da cepa vacinal contra brucelose bovina no sangue de bezerras antes da vacinação.
            Isolamento de fungos endofíticos de Acrocomia aculeata (Jacq.) Lodd. ex Mart. e avaliação do potencial biocida
            Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
            Tipo Tese
            Data 05/10/2020
            Área BIOTECNOLOGIA
            Orientador(es)
            • Maria Ligia Rodrigues Macedo
            Orientando(s)
            • Valdivia Rocha Morceli
            Banca
            • Ana Cristina Jacobowski
            • Caio Fernando Ramalho de Oliveira
            • Janaina de Cassia Orlandi Sardi
            • Maria Ligia Rodrigues Macedo
            • Mayara de Souza Rodrigues
            • Priscila Aiko Hiane Siroma
            Resumo
            Desenvolvimento de Lactobacillus produtores de peptídeos antimicrobianos: uma nova estratégia no desenvolvimento de terapias nutricionais enterais e Avaliação de peptídeos mastoparanos otimizados com rápido potencial bactericida e propriedades antibiofilme
            Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
            Tipo Tese
            Data 23/09/2020
            Área BIOTECNOLOGIA
            Orientador(es)
            • Antonia Railda Roel
            Orientando(s)
            • Ingrid Batista Pinto
            Banca
            • Alda Maria Teixeira Ferreira
            • Antonia Railda Roel
            • Carina Elisei de Oliveira
            • Gisele Regina Rodrigues
            • Grácia Maria Soares Rosinha
            • Isabel Cristina Marques Fensterseifer
            • Sonia Alexandra Leite Velho Mendo Barroso
            Resumo A resistência bacteriana frente aos antibióticos convencionais representa um enorme problema no tratamento de infecções por bactérias e biofilmes principalmente para países em desenvolvimento. No presente estudo propusemos a recombinação heteróloga de estirpes Lactobacillus rhamnosus GG e os peptídeos antimicrobianos clavanina MO e IDR-1018, através de um sistema de clonagem de integração/depuração. Em adição, também avaliamos as atividades antibacteriana e antibiofilme, bem como as estruturas secundárias de um peptídeo natural, denominado mastoparan-L, e suas variantes otimizadas, incluindo mastoparan-R1 e [I5, R8]-MP. Como primeira etapa desta tese, foram caracterizadas as atividades antimicrobianas dos peptídeos clavanina MO e IDR-1018 (entre 16 μg.ml-1 e 64 μg.ml-1) perante as bactérias patogênicas. Ademais, estes mesmos peptídeos não apresentaram atividade contra L. rhamnosus GG viabilizando, assim, usar esse microrganismo como sistema de expressão heteróloga. Os plasmídeos incorporados por eletroporação em Escherichia coli apresentaram perfil de bandas distintas dos plasmídeos originais pEM 76, pEM 181, pEM 181-clavMO, exceto para pEM 94. Entretanto, não houve a digestão por enzimas de restrição nos plasmídeos pEM 76, pEM 181, pEM 181-clavMO derivados da miniprep.. Adicionalmente a fim de avaliar o sinergismo entre PAMs e o L. rhamnosus GG foi empregue um ensaio (spot test) no qual consiste do meio ágar Soft sobresposto ao ágar De Man, Rogosa e Sharp (MRS). Os halos de inibição do Lactobacillus isolado ou associado aos PAMs demonstram efetiva inibição frente a bactérias patogênicas. Ademais outro estudo incluindoo peptídeo [I5, R8]-MP demonstrou as propriedades antibacterianas mais promissoras, causando ainda morte celular entre 10 e 50 min de tratamento in vitro. Além disso, esse peptídeo inibiu em mais de 90% a formação de biofilmes de Escherichia coli e Enterobacter cloacae nas concentrações de 4 e 2 μM, respectivamente. Os estudos de espectroscopia de dicroísmo circular (DC) e dinâmicas moleculares sugerem que os mastoparanos analisados adotaram estrutura em α-hélice na presença de micelas aniônicas. Portanto, presume-se que os plasmídeos utilizados foram incorporados ao cromossomo da bactéria E. coli por apresentarem regiões integrativas homólogas aos Lactobacillus. Em relação aos ensaios do spot test não foi possível afirmar que os efeitos antibacterianos foram potencializados pela interação entre os PAMs e o L. rhamnosus GG. Por fim, o peptídeo [I5, R8]-MP demonstrou potente atividade antibacteriana e antibiofilme. Assim, esses resultados sugerem que Lactobacillus e PAMs podem interagir simultaneamente, preservando as características antibacterianas de ambos. Entretanto, testes adicionais devem ser conduzidos incluindo reavaliar o uso do vetor de expressão e elucidar os mecanismos de ação dos PAMs estudados frente a bactérias patogênicas.
            Síntese e determinação das propriedades farmacológicas do (E)-2 (((4-nitrofenil)imino)metil)fenol
            Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
            Tipo Tese
            Data 17/08/2020
            Área BIOTECNOLOGIA
            Orientador(es)
            • Susana Elisa Moreno
            Orientando(s)
            • Beatriz Cardoso Roriz
            Banca
            • Ângela Alves Nunes
            • Cristiano Marcelo Espinola Carvalho
            • Danieli Fernanda Buccini
            • Luana Silva Soares
            • Nelson Luis de Campos Domingues
            • Susana Elisa Moreno
            Resumo A inflamação é um evento que ocorre em tecidos vascularizados e que tem por finalidade eliminar patógenos visando a homeostase do organismo. Ela envolve uma variedade de células e mediadores inflamatórios que, ao final permitem ao tecido sua completa restauração. Quando o balanço entre inflamação e reparo tecidual é quebrado, há o desenvolvimento de doenças inflamatórias crônicas, como por exemplo, câncer, artrite, asma, entre outros. Uma estratégia para o desenvolvimento de novos anti- inflamatórios é o desenho racional de fármacos por meio da química sintética, tendo em vista a possibilidade de maior efetividade e a redução dos efeitos adversos. As iminas surgem nesse cenário, como compostos sintéticos com várias aplicações na área biológica. Também chamadas de Bases de Schiff, são compostos que possuem o grupo funcional (–C=N–), e tem ganhado importância nas áreas médica e farmacêutica devido a suas atividades relatadas na literatura, como atividade antitumoral, analgésica, anti-inflamatória, nematicida, entre outras. Visando a busca de novos fármacos, o presente trabalho teve por objetivo avaliar a anti-inflamatória da imina (E)-2-(((4-nitrofenil)imino)metil)fenol. A citotoxicidade foi avaliada pelos ensaios de hemólise e MTT. A genotoxicidade foi avaliada pelo ensaio de micronúcleos. Para avaliar a
            atividade anti-inflamatória foram realizados os ensaios de migração de neutrófilos, edema de pata, exsudação pelo azul de evans. A produção de óxido nítrico foi quantificada in vitro e in vivo. Os resultados demonstraram que o composto não apresentou atividade hemolítica em eritrócitos murinos nas concentrações de 100, 50, 25, 12.5, 6.25µg/mL. Em relação à viabilidade celular, o composto, em diferentes concentrações, não alterou a viabilidade de macrófagos em 24 e 48 horas de exposição. O composto também não induziu atividade genotóxica in vivo. A migração de neutrófilos mostrou que o composto reduziu em cerca de 60% o número de leucócitos
            totais e de neutrófilos emigrados para a cavidade peritoneal de camundongos. O ensaio de edema de pata demonstrou que o composto reduziu a formação de edema em todos os tempos mensurados. Essa atividade anti-exsudativa foi comprovada pelo ensaio de
            permeabilidade de azul de Evans. O composto também diminuiu a produção de óxido nítrico, resultado confirmado nos testes de quantificação de nitrito in vitro e in vivo. Os resultados mostraram que o composto (E)-2-(((4-nitrofenil)imino)metil)fenol possui atividade anti-inflamatória promissora e que consiste num potencial candidato para o desenvolvimento de novas drogas anti-inflamatórias.
            Desenho racional de novos peptídeos antimicrobianos a partir de sequência primária de proteína de inseto
            Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
            Tipo Tese
            Data 15/06/2020
            Área BIOTECNOLOGIA
            Orientador(es)
            • Maria Ligia Rodrigues Macedo
            Orientando(s)
            • Amanda Carolina Borges da Silva
            Banca
            • Ana Cristina Jacobowski
            • Edgar Julian Paredes Gamero
            • Eduardo Benedetti Parisotto
            • Gecele Matos Paggi
            • Janaina de Cassia Orlandi Sardi
            • Juliano de Carvalho Cury
            • Maria Ligia Rodrigues Macedo
            Resumo
            Download
              Detecção de Eventos de Transferência Horizontal de Genes usando Regiões Anômalas, Famílias de Proteínas e Reconciliação de Árvores
              Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
              Tipo Tese
              Data 08/04/2020
              Área BIOTECNOLOGIA
              Orientador(es)
              • Nalvo Franco de Almeida Junior
              Orientando(s)
              • ROBSON SOARES SILVA
              Banca
              • Edson Norberto Caceres
              • Flábio Ribeiro de Araújo
              • Henrique Mongelli
              • Luciana Montera Cheung
              • Maria Ligia Rodrigues Macedo
              • Nalvo Franco de Almeida Junior
              Resumo
              Download
                Filogeografia e diversidade genética de Aechmea distichantha Lem. (Bromeliaceae): Implicações evolutivas e conservacionistas
                Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
                Tipo Tese
                Data 27/03/2020
                Área BIOTECNOLOGIA
                Orientador(es)
                • Gecele Matos Paggi
                Orientando(s)
                • Fernanda Maria de Russo Godoy
                Banca
                • Aline Pedroso Lorenz
                • Denise Brentan da Silva
                • Gecele Matos Paggi
                • Gustavo Hassemer
                • Marcos Junji Kitaura
                • Wellington Santos Fava
                Resumo
                Download
                  Propriedades do óleo bruto da semente de Campomanesia adamantium (Cambess.) O. Berg
                  Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
                  Tipo Tese
                  Data 21/02/2020
                  Área BIOTECNOLOGIA
                  Orientador(es)
                  • Arnildo Pott
                  Orientando(s)
                  • David Johane Machate
                  Banca
                  • Arnildo Pott
                  • Danielle Bogo
                  • Juliana Rodrigues Donadon
                  • Lincoln Carlos Silva de Oliveira
                  • Priscila Aiko Hiane Siroma
                  • Rosani do Carmo de Oliveira Arruda
                  • Valdemir Antônio Laura
                  Resumo
                  Atividade antitumoral in vitro de peptídeos Butylatus inspirados no veneno de Tityus serrulatus (Scorpiones)
                  Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
                  Tipo Tese
                  Data 29/08/2019
                  Área BIOTECNOLOGIA
                  Orientador(es)
                  • Cristiano Marcelo Espinola Carvalho
                  Orientando(s)
                  • Simone Camargo Sanches
                  Banca
                  • Antonia Railda Roel
                  • Cristiano Marcelo Espinola Carvalho
                  • Ludovico Migliolo
                  • Renata Trentin Perdomo
                  • Rodrigo Juliano Oliveira
                  • Susana Elisa Moreno
                  Resumo
                  Estudo comparativo de vacinas de DNA contra Brucella abortus nas estratégias DNA Prime-Protein Boost e encapsulação em nanopartículas de quitosana
                  Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
                  Tipo Tese
                  Data 21/08/2019
                  Área BIOTECNOLOGIA
                  Orientador(es)
                  • Grácia Maria Soares Rosinha
                  Orientando(s)
                  • Marrielen Aparecida Benites Caitano Bertolacci
                  Banca
                  • Carina Elisei de Oliveira
                  • Cleber Eduardo Galvão Carvalho
                  • Cristiano Marcelo Espinola Carvalho
                  • Grácia Maria Soares Rosinha
                  • Sebastiao Martins de Souza Neto
                  • Vanessa Felipe de Souza
                  Resumo
                  Identificação de Mycobacterium bovis por espectometria de massas MALDI-TOF em bovídeos
                  Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
                  Tipo Tese
                  Data 08/08/2019
                  Área BIOTECNOLOGIA
                  Orientador(es)
                  • Flábio Ribeiro de Araújo
                  Orientando(s)
                  • Gisele Maria Bacanelli
                  Banca
                  • Carlos Alberto do Nascimento Ramos
                  • Cristiano Marcelo Espinola Carvalho
                  • Cristina Pires de Araujo
                  • Daniele Bier Borges
                  • Flábio Ribeiro de Araújo
                  • Klaudia dos Santos Goncalves Jorge
                  Resumo
                  Purificação e Caracterização de Inibidor da Semente Inga edulis contra atividade antifúngica de Candida ssp.
                  Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
                  Tipo Tese
                  Data 16/01/2019
                  Área BIOTECNOLOGIA
                  Orientador(es)
                  • Maria Ligia Rodrigues Macedo
                  Orientando(s)
                  • Heloisa Helena Guimarães Fernandes Xavier
                  Banca
                  • Ana Cristina Jacobowski
                  • Eduardo Benedetti Parisotto
                  • Maria Ligia Rodrigues Macedo
                  • Priscila Aiko Hiane Siroma
                  • Rosani do Carmo de Oliveira Arruda
                  • Suzy Wider Machado
                  Resumo
                  Detecção de micobactérias não tuberculosas e outras actinobactérias em queijo de coalho artesanal no estado da Paraíba
                  Curso Doutorado em Biotecnologia e Biodiversidade
                  Tipo Tese
                  Data 31/10/2018
                  Área BIOTECNOLOGIA
                  Orientador(es)
                  • Flábio Ribeiro de Araújo
                  Orientando(s)
                  • Elaine Cristina Fernandes Baez Sarti
                  Banca
                  • Andrelisa Vendrami Parra
                  • Cristiano Marcelo Espinola Carvalho
                  • Daniele Bier Borges
                  • Flábio Ribeiro de Araújo
                  • Françoise Carmignan
                  • Luciana Paes de Andrade
                  Resumo
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